Molte infezioni virali, batteriche e fungine sono state implicate nella patogenesi della miocardite.
La causa più comune di miocardite in tutto il mondo è il Trypanosoma cruzi, con circa 18 milioni di persone infette.
In Germania, il parvovirus B19 è l'organismo in prevalenza isolato dalla biopsia endomiocardica, mentre in Giappone il virus dell'epatite C è più comunemente implicato
Negli Stati Uniti, gli adenovirus e gli enterovirus, come il Coxsackie B, sono ritenuti la causa predominante.
É stata implicata inoltre l'infezione SARS-CoV-2 come potenziale agente eziologico durante la pandemia di COVID-19.